As áreas onde serão desenvolvidas as atividades do Jardim Botânico de Piracicaba serão constituídas por coleções de plantas vivas reconhecidas, organizadas, documentadas e identificadas cientificamente com a finalidade de estudo, pesquisa e documentação do patrimônio florísticos da flora regional, especialmente das formações de Floresta Estacional Semidecidual, do bioma Mata Atlântica.

As coleções estarão acessíveis ao público, no todo ou em parte, servindo à educação, à cultura, ao lazer e à conservação ambiental. Os esforços mais significativos para a proteção serão direcionados às espécies raras e ameaçadas, por isso, trata-se de um Jardim de Conservação.

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          As três Áreas que compõem o Jardim Botânico de Piracicaba possuem características e metas distintas, mas complementares, adequadas à sua missão.

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            A Área “Santa Rita”, pelas características da paisagem local, que inclui um grande lago, cercado por área verde, será destinada a receber a maior parte do público, principalmente formado por pessoas que desejam vincular lazer, contato com a natureza e ampliar seu conhecimento sobre as plantas. A vegetação local é composta por um misto de espécies nativas da Floresta Estacional e exóticas, plantadas ou que surgiram espontaneamente. Prevê-se uma diversificação de espécies no local, através de plantio ou de favorecimento de plântulas surgidas espontaneamente, ampliando-se a riqueza de espécies nativas da Floresta Estacional Semidecidual, principalmente aquelas mais raras ou ameaçadas de extinção.

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          Com a finalidade de representar um atrativo adicional aos visitantes, as espécies a serem cultivadas serão agrupadas em módulos temáticos, atendendo a interesses diversos da população, vinculando, assim, atividades de lazer e educativas sobre a biodiversidade da vegetação nativa da região de Piracicaba.

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        O conhecimento sobre a imensa riqueza de espécies úteis, efetivamente utilizadas ou potenciais, favorece a formação de uma postura consciente e preservacionista em relação à natureza, em última análise um dos principais objetivos da constituição de um Jardim Botânico. Adicionalmente pode representar uma fonte para estudos científicos, o que é adequado em um município como Piracicaba, com clara concentração de faculdades e universidades. 

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           Uma vez que está previsto um grande aporte de público neste local, serão concentrados nesta área serviços diversos que atendam as diferentes faixas etárias, incluindo área de playground e visitas guiadas. Espécies exóticas, em caráter excepcional, poderão ser plantadas na área, quando isto for plenamente justificável por questões paisagísticas ou históricas que auxiliem nos aspectos educativos e de lazer.

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           Propõe-se que sejam implantadas no local as seguintes Coleções Botânicas:

           I. Medicinais

           II. Ornamentais:

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           - Por período de floração – primavera, verão, outono e inverno

           - Trepadeiras

           - Ervas e pequenos arbustos

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           III. Ameaçadas

           IV. Frutíferas

           V. Madeira-de-lei     

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         A Área “Engenho Central”, por sua vez, representa um importante local de lazer para a população piracicabana, incluindo áreas de exposição, teatro e uma ampla área verde. Ocorre neste local alguns dos principais eventos da cidade, como a Festa das Nações e o Salão de Humor de Piracicaba, que atrai um grande público também de outras regiões do estado de São Paulo. Assim, os visitantes possuem um perfil com características diferentes e mais diversificado do que aquele descrito para a Área “Santa Rita” e que está, de maneira geral, mais voltado aos aspectos culturais.

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      Essa Área é formada por um complexo de construções históricas entremeada por grandes espaços abertos e uma vegetação composta em sua maior parte por uma floresta com grande predominância de espécies exóticas, algumas de grande porte. A área, assim, do ponto de vista da vegetação, terá uma interferência mínima, evitando a supressão das árvores adultas (assim como nas demais áreas), mas controlando-se espécies oportunistas, como a Leucena (Leucaena leucocephala), ao mesmo tempo, favorecendo as espécies nativas, através de técnicas como coroamento de plantas jovens e o plantio de espécies nativas em substituição àquelas naturalmente suprimidas.  Ao mesmo tempo, nesta área serão organizadas exposições temáticas, aproximando ao tema o público visitante que busca primariamente outros objetivos.

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          A Área “Parque Natural de Santa Terezinha” vêm, ao longo dos últimos anos, sendo enriquecida com espécies nativas. Trata-se de um local com algumas restrições de uso, as quais estão estabelecidas no Plano de Manejo, por tratar-se de uma Unidade de Conservação de Proteção Integral.